冷血杀手少女在执行任务时爱上了目标，她必须在组织的铁律与爱人的温存之间做出死亡抉择。
战国乱世，孤儿阿墨被忍者组织培养成最致命的杀人机器，代号“百人斩”。在这一部中，她接到最后一个任务：刺杀叛逃的前组织头目——重信。阿墨伪装成舞女潜入重信的领地，却在朝夕相处中，被重信那种想要结束乱世、建立和平家园的理想所感化。重信明明知道阿墨是杀手，却依然待她如女儿，教她种田、识字。阿墨第一次感受到了家的温暖。组织下达了最后通牒，并在她的食物中下了慢性毒药作为控制。阿墨必须在毒发身亡前做出选择：是完成使命回归黑暗，还是为了这转瞬即逝的爱与光明，与整个组织同归于尽。片尾，樱花树下，雪染红了白雪。
相比第一部的纯粹杀戮，这一部增加了厚重的悲剧色彩。动作设计依然凌厉，但文戏更加动人。那种“我本是无情剑，却偏偏遇见了磨刀石”的宿命感非常日式美学。结局的决斗戏拍得凄美至极，一刀斩下的是头颅，斩不断的是牵绊。
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一对丧子的老夫妻订购了与亡夫一模一样的仿生人“保罗”，但保罗的算法里，藏着儿子生前宁愿自杀也要掩盖的秘密。
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第三次世界大战后，一名女战士与她的生化人搭档受雇于理想城市奥林帕斯，却发现了管理者消灭人类的惊天阴谋。
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